洁净室的分类一般按气流形式划分，也可按用途和主要控制对象进行划分。

1.洁净室按气流模式分类

     根据气流组织形式，洁净室可分为单向流洁净室、非单向流洁净室、混流洁净室和矢状流洁净室。

2.洁净室按用途和主要控制对象分类

      洁净室按用途和主要控制对象可分为工业洁净室、生物洁净室和生物安全实验室。

3.生物安全实验室

      生物安全实验室是研究有害和传染性微生物、细菌、病毒等的特殊环境条件。因此，生物安全实验室必须安全，不仅要保护实验研究对象，使实验能够得到真实可靠的实验数据和结果，更重要的是要保护实验操作人员和周围环境，使实验室人员及周围环境得到可靠的安全保障。根据世界卫生组织的标准，微生物感染的风险水平根据其不同的风险水平可分为四个不同的等级。此外，不同风险等级的生物安全实验室应具有相应的生物安全等级。